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'''''''Candidatus'' Azoamicaceae'''' es una familia (familia (biología)) de gammaproteobacterias endosimbióticas (endosimbiosis) descritas en 2024 con estado de candidato (Candidatus (biología)). Es monotípico dentro del orden candidato (biología) '''''Ca.'' Azoamicales''' (anteriormente llamado '''grupo eub62A3''').
El nombre de la familia y el orden en el
Los miembros de este grupo se distinguen por su capacidad para llevar a cabo la desnitrificación en su huésped ciliado. La especie tipo ''Ca.'' #Azoamicus ciliaticola|Azoamicus ciliaticola se aisló de la zona anaeróbica de Lago Zug aislado en Suiza y descrito en 2021.>
== Ecología ==
Endosimbiontes beneficiosos para el huésped ( Mientras que ''Ca.'' Azoamicus ciliaticola con un genoma extremadamente reducido aparentemente sólo suministra energía a su anfitrión ciliado en las zonas profundas del lago meromíctico Zug en forma de ATP (Trifosfato de adenosina producido anóxicamente), ''Ca.'' Azosocius aquiferis parece ser uno de los que, en comparación, desempeña un papel más importante en el metabolismo de su huésped. Esto se indica por la retención de la citocromo c oxidasa cbb3 (alias COX) con una transcripción comparativamente alta (biología) del gen ''ccoNOP''[https:// tcdb.org/search/result.php?acc=F8H841&tc=3.D.4.3.3 3.D.4.3.3] – Cbb3 citocromo c oxidasa. Base de datos de clasificación de transportadores (TCDB). para esta enzima.
Esto sugiere que transmiten la capacidad de respirar a su huésped.
Esto podría explicar la distribución mundial de esta asociación simbiótica en hábitats estacional o permanentemente pobres en oxígeno y el importante papel ecológico de esta simbiosis.>
== Sistemática ==
Al 19 de diciembre de 2024
Clase Gammaproteobacteria
* Orden '''''Candidatus (biología)|Candidatus'' Azoamicales''' ** Familia ''''''Candidatus'' Azoamicaceae''' *** Género ''''''Candidatus'' Azoamicus''' **** '''''Aprox.'' #Azoamicus ciliaticola|Azoamicus ciliaticola'''ᵀ **** ''Aprox.'' Azoamicus viridis **** ''Aprox.'' Azoamicus soli **** Clon bacteriano del reservorio de Feitsui Fei_12Nov90m_29 (n.º de acceso AB930564) - Ubicación: presa Feicui, Taiwán>
**** Clon bacteriano del reservorio de Feitsui Fei_12Dec90m_86 (n.º de acceso AB930693) - Ubicación: presa de Feicui, Taiwán>
**** Clon de Lake Pavin eub62A3 — Ubicación: Lac Pavin>>
**** Metaetiqueta del lago Kivu. contig Ga0116204 — Ubicación: Lago Kivu>>
**** Clon de bacteria del Golfo de México EzyYy290 (n.º de acceso KX172462)>
*** Género ''Candidatus'' Azosocius v **** ''Aprox.'' Azosocius agrariusᵀ **** ''Aprox.'' #Azosocius aquiferis|Azosocius aquiferis
-->
*** Género ''CADEGZ01''
**** ''CADEGZ01 sp013286785'' con aislados de bacterias Gammaproteobacteria BWOrgControl_Nextera8_MAG4 (GCA-002422785.1)Nucleótidos NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1850859839 JABDFC010000000].>
**** ''CADEGZ01 sp021848375'' con aislado de bacteria Pseudomonadota SKS4.bin44 (GCA_021848375.1)Nucleótidos NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/2186543794 JABDFC010000000].< /ref>
**** ''CADEGZ01 sp027364575'' con aislado de bacteria clean1871 (GCA_027364575.1)Nucleótidos NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/2417557504 DAHXPC010000000].
**** ''CADEGZ01 sp902827015'' con Proteobacteria sp. RBC072 (GCA_902827015.1)Nucleótido NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1831051932 CADEGZ010000000].>
*** Gattung ''CAMFJH01''
*** Gattung ''JABDCL01''
**** ''JABDCL01 sp013288135'' con aislado de bacteria Gammaproteobacteria BWMinControl_Nextera25_MAG1 (GCA_013288135.1)NCBI Nucleitide: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1850859698 JABDCL010000000].>
*** Gattung ''JABJGS01''
**** ''JABJGS01 sp018703155'' (GCA_018703155.1) con aislado de bacteria Francisellaceae SI074_bin154 (GCA_018703155.1)Nucleótido NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/2047511104 JABJGS010000000].>
*** Gattung ''JAGOUJ01''
**** ''JAGOUJ01 sp018061325'' con aislado de bacteria Gammaproteobacteria Gw_Eff_bin_481 (GCA_OI 8061325.1)Nucleótido NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/2026855077 JAGOUJ010000000].>
*** Gattung ''JAGVLG01''>
*** Gattung ''JAQGOH01''
*** Gattung ''UBA6186''
**** ''UBA6186 sp002422785'' con la bacteria Francisellaceae UBA6186 (GCA_002422785.1)Nucleótido NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1249620604 DITK01000000].
**** ''UBA6186 sp903822055'' con aislado de bacteria Francisellaceae AlinenLipids_bin-5883 (GCA_903822055.1)Nucleótido NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1872009774 CAIJNR010000000].>
**** ''UBA6186 sp903827925'' con aislado de bacteria Francisellaceae A14_bin-2859 (GCA_903827925.1)Nucleótido NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1871442878 CAIKKE010000000].< /ref>>
**** ''UBA6186 sp903907935'' con aislado de bacteria Francisellaceae AlinenLipids_bin-3321 (GCA_903907935.1)Nucleótido NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1872525092 CAIVQA010000000].>
****Unidad taxonómica operativa GEMO|OTU 17862
****Unidad taxonómica operativa GEMO|OTU 10623
*Ordnung Francisellales
** Familia Francisellacae
* Ordnung Legionellales mit Gattung ''Legionella'' (Legionellen)
* Ordnung Berkiellales mit Gattung ''Berkiella''
* Ordnung Coxiellales
* Ordnung Diplorickettsiales
* Orden de__JABCZS01 (GTDB)
** Familia f__JABCZS01 (GTDB)
*** Gattung ''JABCZS01''
**** ''JABCZS01 sp013289085'' con BWOrgControl_Nextera43_MAG1 (GCA_013289085.1)
**** ''JABCZS01 sp013289605'' con BWOrgControl_Nextera69_MAG3 (GCA_013289605.1)
* …
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ᵀ – Typusart
Die Identifizierung der binären Kandidatennamen ''Ca.'' Azoamicus/Azosocius spp. mit dem jeweiligen Stamm (OHIO1/OHIO2/HAIN) erfolgt über die BioSample-Zugriffsnummer (SAM…).
Wie zu erkennen, wurden etliche Stämme bzw. Isolate/Sequenzen herkömmlich der Familie Francisellaceae in der Gammaproteobakterien-Ordnung Thiotrichales (NCBI) oder Francisellales (Speth ''et al.'', 2024) zugeordnet, zählen nach Speth ''et al.'' (2024) und der GTDB aber zur neuen Ordnung und Familia.
== „''Candidatus'' Azoamicus ciliaticola“ ist eine Kandidatenspezies endosymbiotischer Bakterien internalhalb der Familie ''Ca.'' Azoamicaceae.
Sie zeichnet sich ihre Fähigkeit auszeichnen, in ihrem Ciliaten-Wirt auch in anaeroben Gewässern Denitrifikation zu betreiben.
Sie wurde aus dem Zugersee in der Schweiz isoliert und 2021 beschrieben.>
„''Ca.'' Azoamicus ciliaticola“ ist ein obligater Endosymbiont eines anaeroben Süßwasser-Wimpertierchens aus der Klasse (Biologie)|Klasse Plagiopylea.
Este bakterium contiene un genom fuertemente reducido con 0,29 Basenpaar|Mbp (Megabasenpaaren), wobei ein erheblicher Teil davon der Energieproduktion ist.
"California. Azoamicus ciliaticola contiene un conjunto completo de genes para la desnitrificación, lo que lo convierte en el primer endosimbionte obligado observado con dicha vía metabólica.
Su amplio potencial genético para el metabolismo energético sugiere que la función principal del endosimbionte es generar trifosfato de adenosina (ATP) y ponerlo a disposición de su huésped ciliado.
''Aprox.'' Por lo tanto, Azoamicus ciliaticola tiene funciones similares a las mitocondrias, aunque no existe ninguna relación entre este y el linaje bacteriano de las mitocondrias.>
Cuando se descubrió en 2021, surgió la pregunta de si otros eucariotas también utilizan bacterias (o arqueas) para [url=viewtopic.php?t=13475]transferir[/url] electrones a aceptores de electrones no canónicos, como por ejemplo. en el caso de la desnitrificación.
Inicialmente, esto condujo al descubrimiento de otros endosimbiontes bacterianos de ciliados relacionados con ''Ca.'' Azoamicus ciliaticola y, por tanto, a la caracterización de la familia ''Ca.'' Azoamicaceae. br />
== ''Aprox.'' Azosocius aquiferis y sus huéspedes ciliados fueron identificados mediante metagenómica en muestras de agua subterránea de Hainich Curiosamente, a diferencia de la primera especie encontrada ''Ca.'' Azoamicus ciliaticola de la zona anóxica del lago Zug (que sólo controla la respiración anaeróbica, es decir, la desnitrificación), esta especie codifica una oxidasa terminal (la citocromo c oxidasa cbb 3 alias COX).
Esta enzima les permite respirar oxígeno y nitrógeno.>
== Notas ==
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* Benjamin Thompson, Nick Petrić Howe: [https://www.nature.com/articles/d41586-021-00570-6 COVID, 2020 y un año de investigación perdida]. Podcast de naturaleza ( * William H. Lewis, Thijs J. G. Ettema|Thijs J. G. Ettema: ''Un matrimonio microbiano similar a la evolución mitocondrial''. En: ''Nature'', Volumen 591, 3 de marzo de 2021, págs. 375-376;
GTDB: [https://gtdb.ecogenomic.org/tree?r=o__UBA6186 o__UBA6186].
LPSN: [https://lpsn.dsmz.de/genus/azoamicus Género "''Candidatus'' Azoamicus"].
Centro Nacional de Información Biotecnológica | Navegador de taxonomía NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=3119552&lvl=3&p=has_linkout&p=blast_url&p=genome_blast&lin=f&keep=1&srchmode =1&desbloquear Candidato Azoamicaceae], Detalles: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=3119552 "Candidatus Azoamicaceae" Speth et al. 2023]
Centro Nacional de Información Biotecnológica | NCBI BioProject: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1073475 PRJNA1073475]. Genomas endosimbiontes respiratorios recuperados de muestras de agua subterránea.
Centro Nacional de Información Biotecnológica | NCBI BioProject: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB27314 PRJEB27314]. Secuencia del genoma del endosimbionte ciliado Ca. Azoamicus ciliaticola.
Centro Nacional de Información Biotecnológica | Nucleótidos NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/256858899 Clon de Lake Pavin eub62A3]. Adhesión: GQ390243].
Centro Nacional de Información Biotecnológica|NCBI Nucleótidos: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/ab930564 Bacteria no cultivada... clon: Fei_12Nov90m_29]. Adhesión: AB930564.
Centro Nacional de Información Biotecnológica|NCBI Nucleótidos: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/ab930564 Bacteria no cultivada... clon: Fei_12Dec90m_86]. Adhesión: AB930693.
Centro Nacional de Información Biotecnológica | NCBI Nucleótidos: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/kx172462 Clon de bacteria no cultivada EzyYy290…]. Adhesión: KX172462.
[https://www.hidro.uni-jena.de/72/hcze Exploración de la zona crítica de Hainich]. Universidad Friedrich Schiller de Jena, Facultad de Geociencias Químicas, Cátedra de Hidrogeología.
[https://gold.jgi.doe.gov/analysis_project?id=Ga00116204 ID del proyecto de análisis GOLD: Ga0116204]. ID de envío de IMG: 94481. Instituto Conjunto del Genoma, Departamento de Energía de los Estados Unidos (gold.jgi.doe.gov).
* [https://mpi-bremen.de/es/Nueva-forma-de-simbiosis-descubierta.html Nueva forma de simbiosis descubierta]. En: Instituto Max Planck de Microbiología Marina (MPI-MM) a partir del 3 de marzo de 2021 ( ** [https://mpi-bremen.de/Neue-Form-der-Symbiose-entdeckt.html Descubierta una nueva forma de simbiosis].
*PrePrint en bioRxiv desde el 19 de febrero de 2024; doi:10.1101/2024.02.19.580942.
** [https://www.eurekalert.org/news-releases/1067572?language=german Más que solo oxígeno: diversidad y metabolismo de endosimbiontes globales].
* [https://mpi-bremen.de/es/El-oxígeno-no-es-el-límite-de-la-diversidad-y-el-potencial-metabólico-de-los-endosimbiontes-globalmente-distribuidos.html El oxígeno i
More details: [url]https://de.wikipedia.org/wiki/Azoamicaceae[/url]