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 Nombres de hongos

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'''Fungal Names''' ('''FN''') es uno de los tres repositorios reconocidos internacionalmente para el registro de nombres de hongos, junto con Index Fungorum y MycoBank. Es operado por el Laboratorio Estatal Clave de Micología del Instituto de Microbiología de la Academia de Ciencias de China. La plataforma se lanzó en 2011 y fue reconocida en 2012 por el Comité de Nomenclatura de Hongos (NCF) y ratificada por la Asociación Micológica Internacional como repositorio de registro oficial. Según el Código internacional de nomenclatura (Código internacional de nomenclatura para algas, hongos y plantas), los nuevos nombres de hongos publicados a partir del 1 de enero de 2013 (y las epitipificaciones de lectotipo (lecto-, neotipo) o epitipo (epitipo) a partir del 1 de enero de 2019) deben citar un identificador emitido por uno de los repositorios reconocidos; FN emite dichos identificadores y sincroniza los registros con los demás repositorios. A principios de 2022, FN indexó más de 567 000 nombres de taxones y 147 000 registros de tipos e integra enlaces a especímenes, colecciones de cultivos y herbarios/fungarios, publicaciones y taxónomos.>

==Historia==

La creación de FN siguió a problemas largamente reconocidos en la nomenclatura fúngica, donde la literatura histórica y las bases de datos contienen sinonimia (sinonimia), homónimo (biología) (homonimia), isonimia (isonimia), variantes ortográficas y nombres mal aplicados que dificultan el uso inequívoco. Según el Capítulo F del Código Internacional de Nomenclatura para algas, hongos y plantas | Código, art. F.5 exige que las novedades de nomenclatura publicadas a partir del 1 de enero de 2013 citen un identificador emitido por un repositorio reconocido y, a partir del 1 de enero de 2019, aplica el mismo requisito de registro a las lectotipificaciones, neotipificaciones y epitipificaciones. La guía de mejores prácticas contemporáneas para autores resume estas obligaciones e identifica los tres repositorios reconocidos como Fungal Names, Index Fungorum y MycoBank. FN se estableció en septiembre de 2011 y, en diciembre de 2012, fue reconocido como uno de los tres repositorios de registro globales junto con Index Fungorum y MycoBank. Los identificadores son únicos y mutuamente aceptados entre los tres sistemas; en el momento de la publicación (2023), FN asignaba números en el rango 570000–579999, y los repositorios comparten actualizaciones a través de interfaces de programación de aplicaciones de forma regular. Las cuentas contemporáneas también describieron el papel de MycoBank como centro de coordinación que facilita el intercambio de datos entre los tres repositorios durante la implementación del registro obligatorio.>

==Alcance y propósito==

FN sirve simultáneamente como una plataforma de registro para novedades de nomenclatura (nuevos taxones, nuevas combinaciones, nombres de reemplazo y nombres en nuevos rangos taxonómicos) y como una base de conocimiento que integra la nomenclatura con información sobre tipos, agencias preservadoras, colecciones de cultivos, herbarios/fungarios, publicaciones e investigadores que publican nombres de hongos. Al estandarizar los nombres y vincularlos con recursos externos (incluidos Index Fungorum, MycoBank y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (Taxonomía NCBI), FN tiene como objetivo reducir la inconsistencia, evitar la homonimia en el momento del registro y facilitar el intercambio y la recuperación de datos confiables entre los recursos de biodiversidad de hongos.>

==Funciones y características==

El flujo de trabajo de registro emite un identificador inmediatamente después del envío, seguido de la revisión del administrador (normalmente dentro de las 24 horas). Si se solicita una revisión y no se recibe respuesta dentro del plazo establecido, se podrá retirar un identificador emitido previamente. Durante el envío, el sistema normaliza la entrada ofreciendo opciones controladas para nombres de autores, agencias de preservación y países de colección, y compara el nombre propuesto con una referencia estandarizada de nombres de hongos existentes para evitar la creación de homónimos. Además de los 27 rangos principales y secundarios utilizados en la taxonomía de hongos, FN incluye "otro rango" para capturar usos excepcionales o de transición propuestos en la literatura.>

Las funciones de búsqueda y visualización permiten consultas por rango (desde taxones infraespecíficos hasta categorías superiores), epíteto (nombre botánico), año de publicación e identificador de registro; Los registros del autor, la revista y la agencia de conservación tienen páginas de detalles interconectadas. Estos muestran taxonomía, tipificación, bibliografía y referencias cruzadas con los otros repositorios cuando estén disponibles. FN también proporciona una herramienta de alineación de secuencia de espaciador transcrito interno (ITS) (utilizando códigos de barras de ADN#UNITE|datos UNITE) para la identificación preliminar de muestras, retorno de alineamientos de secuencia, una vista de árbol simple filogenético y enlaces a las entradas correspondientes en FN y NCBI. Una herramienta de estandarización de nombres implementa el principio de "un hongo, un nombre" al resolver errores ortográficos y usos variantes de un nombre actual; una opción de búsqueda aproximada de coincidencia de cadenas enumera nombres escritos de manera similar con porcentajes de identidad para ayudar a los usuarios a encontrar el registro correcto cuando la entrada es incierta.>

==Contenido y procesamiento de datos==

FN incluye más de 567.000 nombres de taxones que abarcan hongos sensu lato (incluidos hongos fósiles y taxones históricos similares a hongos), con más de 149.000 nombres actuales a nivel de especie. Almacena más de 120.000 registros de colecciones científicas de especímenes tipo y varios miles de registros de ilustraciones tipo, e integra más de 10.000 revistas y libros relacionados con la micología que han publicado nombres de hongos. El sistema también mantiene un conjunto de datos de autores que cubre más de 25.000 taxónomos y unos 750.000 pares de nombres de autor derivados de registros publicados. Los nombres y las actualizaciones recién publicados se intercambian entre los tres repositorios reconocidos en un ciclo mensual, incluidos cambios de nomenclatura, tipos, clasificación y nuevos registros.>

Para respaldar una recuperación coherente, las denotaciones de rangos históricos (más de cien términos) se reclasifican en catorce rangos principales y secundarios estándar; los registros se limpian, validan y vinculan con Index Fungorum, MycoBank y la taxonomía NCBI. Los datos de tipificación (holotipos, lectotipos, epitipos y neotipos) se asignan a biorrepositorios|biorrepositorios, y las abreviaturas de las colecciones de cultivos y herbarios/fungarios se normalizan según los estándares públicos. FN vincula las cepas tipo con el Catálogo global de microorganismos, donde hay números disponibles, e integra conjuntos de datos que cubren cientos de colecciones de cultivos y varios miles de herbarios y hongos en todo el mundo.>

==Estadísticas y uso==

La base de datos proporciona un panel en vivo de recuentos de nombres, tipificaciones, taxónomos, publicaciones y agencias de preservación, junto con resúmenes geográficos. Las tendencias históricas indican un crecimiento lento en los nombres publicados hasta finales del siglo XIX, un aumento pronunciado desde la década de 1870 hasta el final del siglo, una pausa a mediados del siglo XX y una aceleración renovada desde finales del siglo XX en adelante vinculada a métodos moleculares (filogenética molecular) y códigos de barras de ADN. A principios de 2022, se disponía de información sobre tipificación de aproximadamente 147 000 nombres, incluidos más de 120 000 registros de colecciones de especímenes y miles de ilustraciones tipográficas; la mayoría de los géneros utilizados actualmente tenían una especie tipo designada, y una proporción sustancial de los nombres actuales a nivel de especie tenían tipos indexados con detalles de agencia preservados. Las mayores existencias individuales de material de tipo fúngico se concentran en un pequeño número de colecciones de cultivos y herbarios/fungarios en Europa, Asia, Oceanía, África y América del Norte, lo que refleja la difusión global de recursos micológicos seleccionados.>

==Acceso y disponibilidad==

FN es de acceso gratuito para uso académico a través de un sitio web público y expone una API para el intercambio de datos programático. Los repositorios se coordinan para compartir nuevos registros y actualizaciones a intervalos regulares, asegurando que los identificadores y los eventos de tipificación sean detectables en todas las plataformas y que las bases de datos posteriores puedan resolver nombres de manera consistente.>






Bases de datos de micología
Bases de datos de taxonomía en línea

More details: https://en.wikipedia.org/wiki/Fungal_Names

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