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Microgenomatía

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Post by Anonymous » 09 Mar 2026, 10:01

''Candidatus (Biología)|Candidatus'' '''Microgenomatia''' es una clase (Biología)|Clase de bacterias del filo (División (Biología)|División) Minisyncoccota (anteriormente llamado ''Candidatus (Biología)|Ca.'' Patescibacteriota o grupo CPR).

== Descripción ==
=== La clase actual “''Ca.'' Microgenomatia” originalmente se llamaba filo “Microgenomatos” o
=== En 2020, Vitaly V. Kadnikov et al. informó sobre la cepa Ch65 de Microgenomatia (Contig#MAGs|MAG), que secuenciaron mediante metagenómica. Según sugerencia de estos autores, Ch65 sirve como referencia para la nueva especie candidata "''Ca.'' Chazhemtobacterium Aquaticus" [LPSN: "''Ca.'' Chazhemtonibacterium Aquaticus"], especie tipo de la también nueva familia "Ca. Chazhemtonibacteriaceae", con familia hermana de la familia GTDB fUBA12108 ["''Ca.'' Collierbacteraceae”]; ambos en orden GTDB oUBA1400.>

Aunque las bacterias Ch65 no se pudieron cultivar, también son acuáticas porque su ADN proviene de un acuífero térmico subterráneo (~20°C|°C,La temperatura del agua fue más baja de lo esperado para un gradiente de temperatura típico de aproximadamente 20 Celsius|°C/kilómetro|km, pero es posible que el agua se haya enfriado a medida que fluía a través del pozo. pH valor|pH 7,43–7,60) en el pozo de producción de petróleo 5P de 2,8 km de profundidad cerca del pueblo de Chazhemto[https://mapcarta.com/de/15362434 Chazhemto]. En: Mapcarta (
El genoma Ch65 tiene 801.504 pares de bases (pb) de largo, tiene 838 genes codificantes (código genético de proteína) y tiene un contenido de G+C de 44,80%. Tiene una composición de nucleótidos muy inusual, con una hebra en toda su longitud que tiene un alto contenido de citosina en comparación con la guanina. Esto sugiere que la mayor parte del cromosoma bacteriano Ch65 se replica en una dirección. Sin embargo, tal asimetría en la composición de nucleótidos también se observó en las familias GTDB fUBA12108 [“''Ca.'' Collierbacteraceae] y fCG1-02-47-37 ['''Ca.'' Beckwithbacteraceae'] (ambas también en el orden GTDB oUBA1400 ['''Ca.'' Chazhemtobacteriales"]).

Un análisis del genoma reveló que la bacteria Ch65 probablemente tiene forma de bastón y es móvil. Tiene un estilo de vida anaeróbico, es decir, es organotrófico obligado con un metabolismo fermentativo, por lo que puede producir acetato y lactato.
Sin embargo, no tiene cadena respiratoria ni vías metabólicas completas para la biosíntesis de ácidos grasos/lípidos, aminoácidos y nucleótidos.
La vía de la glucólisis de Embden-Meyerhof (glucólisis) y la vía de las pentosas fosfato no oxidativas (vía de las pentosas fosfato) están en gran parte completas, pero no se encontraron genes para la glucoquinasa (GCK), la fosfofructoquinasa 1 | 6-fosfofructoquinasa (PFK1) y la transaldolasa (TAL).
La bacteria Ch65 carece de glicosidasas secretadas (glucósido hidrolasas) y transportadores convencionales (proteína de membrana) para la importación de azúcares y aminoácidos.

Las propiedades metabólicas predichas a partir de la secuencia de ADN indican que Ch65 es
* vive de desechos|escombros (biología) (“carroña microbiana”) y obtiene recursos de la biomasa microbiana lisada|lisis (biología), o
* en simbiosis (posiblemente parasitarias) con otros organismos, como es demostrablemente el caso de otras clases de Minisyncocota (por ejemplo, Minisyncoccia y Saccharimonadia).>

=== Biosíntesis de purinas ===
Como también encontraron estos autores, las cepas SCGC AAA011-A19 y SCGC AAA011-L05 (ambas del subclado OP11-1) utilizan una ruta metabólica para la biosíntesis de las purinas adenina y guanina que sólo se conoce de archaea y probablemente se lleva a cabo por representantes del reino Methanobacteriati (reino de archaea (biología)) a través de transferencia lateral de genes (LGT). (antes llamada “Euryarchaeida” o “Euryarchaeota”).
La biosíntesis de purinas se realiza en bacterias y arqueas con respecto a su penúltimo paso (el ribonucleadoWikcionario: wikt:en:ribonucleate|ribonucleate ( Todas las bacterias secuenciadas hasta ese momento (2013) utilizan la enzima PurH1 para este paso, mientras que la mayoría de las arqueas utilizan la enzima PurP.>>
Sin embargo, los miembros de Minisyncoccota (anteriormente: "''Ca.'' Patescibacteriota" o "Patescibacteria") no tienen el gen "purH1", sino que tienen un gen similar a "purP": las metanobacterias utilizan la enzima PurP para este paso. Como argumentan los autores, esto sugiere una antigua transferencia lateral de la mayor parte del operón de biosíntesis de purina de un donante similar a los termococos al ancestro de Minisyncoccota (“Patescibacteria”).

=== Propiedades del genoma (oUBA1400) ===
Tamaños del genoma y composición de nucleótidos de genomas completos de miembros del orden candidato o__UBA1400 [“''Ca.'' Chazhemtobacteriales”]:

== Sistemática ==
En Christian Rinke ''et al.'' (2013) el clado OP11 todavía se clasifica como un filo (departamento (biología)|departamento,
El sistema del grupo al 7 de marzo de 2026 (extractos) es el siguiente:

Clase “''Ca.'' '''Microgenomatia'''” -->
* Orden ''incertae sedis''(L)
Clado (¿familia?) OP11-1(R)
* Género ''incertae sedis''
** Especie Microgenomatos bacteria SCGC AAA011-A19(N,R) [División candidata OP11 bacteria SCGC AAA011-A19(N)]
Especie Microgenomatos bacteria SCGC AAA011-L05(N,R) [División candidata OP11 bacteria SCGC AAA011-L05(N)]
Especie Microgenomatos bacteria SCGC AAA011-F5(N,R) [División candidata OP11 bacteria SCGC AAA011-F5(N)]
Clado (¿familia?) OP11-2(R)
* Género ''incertae sedis''
Especie Microgenomatos bacteria SCGC AAA255−J07(N,R) [División candidata OP11 bacteria SCGC AAA255−J07(N)]
Especie Microgenomatos bacteria SCGC AAA011−B20(N,R) [División candidata OP11 bacteria SCGC AAA011−B20(N)]
Clado (¿familia?) OP11-4b(R)
* Género “''Ca.'' '''Microgenomatus'''” Especie “''Aprox.'' '''Microgenomatus auricola'''” Especie ''Aprox.'' Microgenomatus sp. aislar SulCav_AS07-7_2_38_32(N)
Especie ''Aprox.'' Microgenomatus sp. aislar SulCav_AS07-7_35_29(N)
Especie ''Aprox.'' Microgenomatus sp. aislar BE2012_2_50_27(N)
* Gattung ''incertae sedis''
** Spezies ''Ca.'' Microgenomates bacteria SCGC AAA011-M05(N,R) [División candidata OP11 bacteria SCGC AAA011-M05(N)]
Spezies Bacteria OP11 de división candidata no cultivada … clon BB35(N) mit Stamm 83319022(R) alias BB35(N)
Klade (¿Familia?) OP11-4c(R)
* Gattung ''incertae sedis''
Spezies Microgenomates bacteria SCGC AAA011-L6(N,R) [División candidata OP11 bacteria SCGC AAA011-L6(N)]
Familia y Gattung ''incertae sedis''
**:* Spezies Microgenomates bacteria SCGC AAA011−B20(N,R) [División candidata OP11 bacteria SCGC AAA011-B20(N)]
**:* Especies **:* Especies
* Ordnung „''Ca.'' Chazhemtobacteriales“(G°) [o__UBA1400(G)]
* Gattung ''CG1-02-47-37''(G)
** Spezies ''CG1-02-47-37 sp002772455''(G) [''Ca.'' Bacteria Beckwithbacteria CG23_combo_of_CG06-09_8_20_14_all_47_9(N,G)]
* Gattung ''GWC1-49-16''
** Spezies ''GWC1-49-16 sp001029675''(G) [''Ca.'' Bacteria Beckwithbacteria GW2011_GWC1_49_16(N,G)]
* Gattung ''PSRQ01''(G)
Spezies ''PSRQ01 sp003176165''(G) [''Ca.'' Cerribacteria bacteria 'Amazon FNV 2010 28 9'(N,G)]
* Gattung ''UBA12028''
** Spezies ''UBA12028 sp001002285''(G) [Bacteria del grupo de microgenomatos GW2011_GWC1_46_15(N,G)]
* Gattung …(G)
Familia „''Ca.'' Chazhemtonibacteriaceae“ corrig. * Gattung „''Ca.'' Chazhemtonibacterium“ corrig. ** Spezies „''Ca.'' Chazhemtonibacterium acuáticos“ corrig. -->
* Gattung ''2-01-FULL-49-14''(G)
Spezies ''2-01-FULL-49-14 sp001816915''(G) [''Ca.'' Chisholmbacteria bacteria RIFCSPLOWO2_01_FULL_49_14(N,G)]
* Gattung …(G)
* Gattung ''UBA12108''(G)
** Spezies ''UBA12108 sp001002415''(G) [''Ca.'' Collierbacteria bacteria RIFOXYD1_FULL_46_26(N,G)]
* Gattung …(G)
* Gattung ''incertae sedis''
Spezies Candidatus Collierbacteria bacteria RIFOXYD2_FULL_45_13(N)>
* Gattung ''1-14-0-10-56-10''
Spezies ''1-14-0-10-56-10 sp002772645''(G) [''Ca.'' Pacebacteria bacteria CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_56_10(N,G)]
* Gattung ''CG1-02-43-3''
** Spezies ''CG1-02-43-31 sp002788675''(G) [''Ca.'' Pacebacteria bacteria CG_4_9_14_0_2_um_filter_40_15(N,G)]
* Gattung ''CG2-30-36-39''
** Spezies ''CG2-30-36-39 sp001873435''(G) [''Ca.'' Pacebacteria bacteria CG2_30_36_39(N,G)
* Gattung ''PJMF01''(G)
** Spezies ''PJMF01 sp003173865''(G) [''Ca.'' Aislado de bacteria Minisyncoccota Amazon_FNV_2010_13_2_2(N), ''Ca.'' Aislado de bacteria Paceibacterota Amazon_FNV_2010_13_2_2(G)]
* Gattung ''UBA10119''
** Spezies ''UBA10119 sp001002135''(G) [''Ca.'' Pacebacteria bacteria GW2011_GWA1_46_10(N,G)]
* Gattung ''UBA1364''
** Spezies ''UBA1364 sp020724725''(G) [''Ca.'' Microgenomatus sp. aislar BE2012_5_35_30(N,G)]
Spezies ''UBA1364 sp001029715''(G) [División candidata bacteria TM6 GW2011_GWF2_28_16(N,G)]
* Gattung ''UBA1388''
** Spezies ''UBA1388 sp002772705''(G) [''Ca.'' Pacebacteria bacteria CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_44_11(N,G)]
* Gattung ''UM-FILTER-42-14''** Spezies ''UM-FILTER-42-14 sp002772695''(G) [''Ca.'' Pacebacteria bacteria CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_44_54(N,G)]
* Gattung …(G)
Familia fMFAQ01(G) – abgetrennt von „#Collierbacteria|Collierbacteraceae“ [fUBA12108]
* Gattung ''MFAQ01''(G)
** Spezies ''MFAQ01 sp001776275''(G) [''Ca.'' Collierbacteria bacteria RIFOXYD1_FULL_40_9(N,G)]
* Gattung ''UBA2277''(G)
** Spezies ''UBA2277 sp000998275''(G) [''Ca.'' Bacteria Collierbacteria GW2011_GWA2_42_17(N,G), División candidata Bacteria CPR1 GW2011_GWA2_42_17(N,G)Beide Stämme werden here (im Gegensatz zu GTDB und der NCBI-Taxonomie) como alias aufgefasst: der lange Name sollte eindeutig sein.
* Gattung …(G)
Familia f__PJMF01(G)
* Gattung ''UBA1364''(G)
** Spezies ''UBA1364 sp020724725''(G) [''Ca.'' Microgenomatus sp. aislar BE2012_4_39_12(N)] (movido)
Familia fUBA1400(G) – separada de “#Beckwithbacteria|Beckwithbacteraceae” [fCG1-02-47-37]
* Género ''1-14-0-10-34-10''(G)
Especie ''1-14-0-10-34-10 sp002773945''(G) [''Aprox.'' Bacteria Beckwithbacteria CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_34_10(N,G)]
* Género ''UBA1400''(G)
** Especie ''UBA1400 sp002305125''(G) [Bacteria del grupo Patescibacteria UBA1400(N,G)]
* Género…(G)
Familia fUBA1449(G) – separada de “#Beckwithbacteria|Beckwithbacteraceae” [fCG1-02-47-37]
* Género ''JAAZND01''
** Especie ''JAAZND01 sp012798485''(G) [''Aprox.'' Aislamientos de bacteria Beckwithbacteria AS27yjCOA_127(N,G)]
* Género ''JAAZOH01''
** Especie ''JAAZOH01 sp012797845''(G) [''Aprox.'' Aislamientos de bacteria Beckwithbacteria AS27yjCOA_42(N,G)]
* Género ''UBA1449''(G)
** Especie ''UBA1449 sp002335355''(G) [Bacteria del grupo Patescibacteria UBA1449(N,G)
Familia…(G)

* Familia f__DATCJB01(G)
* Género ''DATCJB01''(G)
** Especie ''DATCJB01 sp036507455''(G) [Aislamientos de bacterias del grupo Patescibacteria SMAG_U7874(N,G)]
Familia f__GWA2-41-24(G)según GTDB, todas las cepas identificadas como Curtissbacteria en la taxonomía NCBI pertenecen a esta familia.
* Género ''GWA2-41-24''(G)
Especie ''GWA2-41-24 sp001775055''(G) [''Aprox.'' Curtissbacteria bacteria RIFCSPLOWO2_02_41_11(N,G)]
* Género…(G)

* Familia f__UBA10151(G)
* Género ''GWC1-40-9''(G)
** Especie ''GWC1-40-9 sp000997385''(G) [''Aprox.'' Daviesbacteria bacteria GW2011_GWA1_41_61(N,G)]
* Género ''UBA10151''(G)
** Especie ''UBA10151 sp001776935''(G) [''Aprox.'' Daviesbacteria bacteria RIFCSPLOWO2_01_FULL_39_23(N,G)]
* Género…(G)

* Familia f__UBA10105(G)
* Género ''UBA10105''(G)
** Especie ''UBA10105 sp000995415''(G) [''Aprox.'' Gottesmannbacteria bacteria GW2011_GWC1_43_10(N,G)]
Familia…(G)

* Familia f__GWA1-39-11(G)
* Género ''SURF-62''(G)
Especie ''SURF-62 sp003599595''(G) [''Aprox.'' Aislamientos de la bacteria Parcubacteria SURF_62(N,G)]
Familia fJACOYD01(G)
Familia fUBA12049(G)según GTDB, casi todas las cepas etiquetadas como Levybacteria en la taxonomía NCBI pertenecen a esta familia.
* Género ''01-FULL-36-15b''
** Especie ''01-FULL-36-15b sp001782035''(G) [''Aprox.'' Levybacteria bacteria RIFCSPHIGHO2_01_FULL_37_17(N,G)]

* Familia f__GWC2-37-13(G)
* Género ''GWC2-37-13''(G)
** Especie ''GWC2-37-13 sp000990305'' [''Aprox.'' Roizmanbacteria bacteria GW2011_GWC2_34_23(N,G)]
Especie ''GWC2-37-13 sp000990565'' [''Aprox.'' Bacteria Roizmanbacteria GW2011_GWC1_37_12(N,G)]
* Gattung ''UBA1450''(G)
** Spezies ''UBA1450 sp000990445''(G) [''Ca.'' Roizmanbacteria bacteria GW2011_GWA2_37_7(N,G)
Spezies ''UBA1450 sp002329205''(G) [’’Ca.’’ Candidatus Roizmanbacteria bacteria UBA1450(N,G)
* Gattung „''Roizmanbacterium''“ ** Spezies ''Ca.'' Roizmanbacterium ADI133>
* Gattung …(G)
Familia f__HO2-37-13b
* Gattung ''OLB22''(G)
** Spezies ''OLB22 sp001567515''(G) [Microgenomates bacteria OLB22(N,G), División candidata OP11 bacteria OLB22(N)]
* Gattung ''OLB23''(G)
** Spezies ''OLB23 sp001567245''(G) [Microgenomates bacteria OLB23(N,G), División candidata OP11 bacteria OLB23(N)]
* Gattung …(G)
** Familia f_UBA1406(G)

* Familia BS750m-G30(G)
Familia fJAHJSD01(G)
** Familia fJAUWLS01(G)
Familia fUBA12405(G)
* Gattung ''UBA12405''
** Spezies ''UBA12405 sp003542615''(G) [''Ca.'' Aislado de bacteria Shapirobacteria UBA12405(N,G)]
Familia fUBA6130(G)

* ** Familia f2-01-FULL-43-14(G)
Familia fJBBROZ01(G)
Familia fRBG-16-39-9b(G)nach der GTDB gehören fast alle in der NCBI-Taxonomie as Woykebacteria gekennzeichneten Stämme zu esta familia.

* Ordnung o0-14-0-10-38-17(G) – abgetrennt von „#Shapirobacteria|Shapirobacterales“ [oUBA12405]
** Familia f0-14-0-10-38-17(G)
* Gattung ''0-14-0-10-38-17''(G)
Spezies ''0-14-0-10-38-17 sp002774085''(G) [''Ca.'' Bacteria Shapirobacteria CG09_land_8_20_14_0_10_38_17(N,G)]
* Gattung ''01-FULL-43-15b''
Spezies ''01-FULL-43-15b sp001816385''(G) [''Ca.'' Bacteria Blackburnbacteria RIFCSPHIGHO2_01_FULL_43_15b(N,G)]
* Gattung ''2-12-FULL-44-25''(G)
** Spezies ''2-12-FULL-44-25 sp001816455''(G) [''Ca.'' Bacteria Blackburnbacteria RIFCSPHIGHO2_12_FULL_44_25(N,G)]
* Gattung ''GCA-2686465''(G)
** Spezies ''GCA-2686465 sp002686465''(G) [''Ca.'' Aislado de bacteria Woesebacteria ARS1183(N,G)] (verschoben)
* Gattung ''JACPEJ01''(G)
** Spezies ''JACPEJ01 sp016183565''(G) [''Ca.'' Aislado de bacteria Blackburnbacteria NC_groundwater_332_Ag_B-0.1um_41_18(N,G)]
* Gattung ''UBA10165''(G)
** Spezies ''BA10165 sp001816475''(G) [''Ca.'' Bacteria Blackburnbacteria RIFCSPLOWO2_01_FULL_40_20(N,G)]
* Gattung …(G)
* Gattung ''2-01-FULL-44-10''(G)
** Spezies ''2-01-FULL-44-10 sp001792465''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria RIFCSPHIGHO2_01_FULL_44_10(N,G)]
* Gattung ''DYGS01''(G)
** Spezies ''DYGS01 sp020724585''(G) [''Ca.'' Microgenomatus sp. aislar BE2012_5_35_30(N,G)]
* Gattung ''DYGT01''(G)
** Spezies ''DYGT01 sp020724555''(G) [''Ca.'' Microgenomatus sp. aislar BE2012_6_40_25(N,G)]
* Gattung ''GWB1-39-12''(G)
** Spezies ''GWB1-39-12 sp000993405''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria GW2011_GWB1_39_12(N,G)]
* Gattung ''GWC1-37-12b''(G)
** Spezies ''GWC1-37-12b sp000993115''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria GW2011_GWB1_38_8b(N,G)]
* Gattung ''GWC1-42-9''(G)
** Spezies ''GWC1-42-9 sp000995185''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria GW2011_GWC1_42_9(N,G)]
* Gattung ''GWF1-31-35''(G)
** Spezies ''GWF1-31-35 sp001029755''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria GW2011_GWF1_31_35(N,G)]
* Gattung ''LCIL01''(G)
** Spezies ''LCIL01 sp001001045''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria GW2011_GWA1_44_23(N,G)]
* Gattung ''RBG-16-42-24''(G)
** Spezies ''RBG-16-42-24 sp001792115''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria RBG_16_42_24(N,G)]
* Gattung ''UBA12026''(G)
** Spezies ''UBA12026 sp000990005''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria GW2011_GWB1_33_38(N,G)]
* Gattung ''UBA8517''(G)
* Gattung ''WO2-FULL-39-9''(G)
Spezies ''WO2-FULL-39-9 sp001793155''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria RIFCSPLOWO2_01_FULL_39_61(N,G)]
* Gattung ''WO2-FULL-39-10''(G)
** Spezies ''WO2-FULL-39-10 sp001792345''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria RIFCSPHIGHO2_01_FULL_39_32(N,G)]
* Gattung …(G)
Familia fGWA2-44-7(G)
* Gattung ''GWA2-44-7''(G)
Familia fUBA8517(G)
* Gattung ''DYGS01''(G)
** Spezies ''DYGS01 sp020724585''(G) [''Ca.'' Microgenomatus sp. aislar BE2012_5_35_30(N)] (verschoben)
* Gattung ''DYGT01''(G)
** Spezies ''DYGT01 sp020724555''(G) [''Ca.'' Microgenomatus sp. aislar BE2012_6_40_25(N)] (movido)
Familia…(G)

* Orden oJACOXO01(G) – separado de “# Gottesmannbacteria| Gottesmannbacterales” [oUBA10105]
Familia f__JACOXO01(G)
* Género ''JACOXO01''(G)
**** Especie ''JACOXO01 sp016182365''(G) [''Aprox.'' Aislamientos de la bacteria Gottesmannbacteria NC_groundwater_155_Ag_S-0.1um_35_9(N,G)]

* Orden oJACPZF01(G) – separado de “# Gottesmannbacteria| Gottesmannbacterales” [oUBA10105]
Familia f__JACPZF01(G)
* Género ''JACPZF01''(G)
** Especie ''JACPZF01 sp016195615''(G) [''Aprox.'' ''Aprox.'' Aislamientos de la bacteria Gottesmannbacteria NC_groundwater_155_Ag_S-0.1um_35_9(N,G)]
* Género…(G)

* Orden oPFEM01(G) – separado de “#Shapirobacteria|Shapirobacterales” [oUBA12405]
Familia f__PFEM01(G)
** Especie ''PFEM01 sp002793635''(G) [''Aprox.'' Bacteria Shapirobacteria CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_48_15(N,G)]

* Orden oUM-FILTER-39-15(G) - separado de "#Shapirobacteria|Shapirobacterales" [oUBA12405]
Familia UM-FILTER-39-15(G)
** Especie ''UM-FILTER-39-15 sp002784465''(G) [''Aprox.'' Bacteria Shapirobacteria CG_4_10_14_0_8_um_filter_39_15(N,G)]

* Orden oUM-FILTER-40-11(G) - separado de "#Shapirobacteria|Shapirobacterales" [oUBA12405]
Familia fUM-FILTER-40-11(G)
** Especie ''UM-FILTER-40-11 sp002780305''(G) [''Aprox.'' Aislamiento de bacteria Shapirobacteria SZUA-533(N,G)]

* Orden oVGLL01(G) – separado de “#Shapirobacteria|Shapirobacterales” [oUBA12405]
Familia fVGLL01(G)
** Especie ''VGLL01 sp016866735''(G) [''Aprox.'' Aislado de bacteria Shapirobacteria BS750m-G30(N,G)]

* Está bien...(G)

Turnos según GTDB:
* por clase “''Ca.'' Patescibacteriia”:
Cepa ''Microgenomatus auricola'' Bin_28_1_1(N) ⇒ ''Microgenomatus_A auricola_A''(G)
Cepa ''Microgenomatus auricola'' Bin_40(N) ⇒ ''Microgenomatus_B auricola_A''(G)
* por clase Minisyncoccia:
** ''Aprox.'' Microgenomatus sp. aislar BE2012_3_53_27(N) ⇒ ''DYGI01 sp020724805''(G)
----
L- L° – entrada LPSN huérfana (taxón sin sistemática interna y externa designada, pero posiblemente Sinónimos),
* N – Taxonomía de G- G° – GTDB (obsoleto) Versión 09-RS220>
* R – Christian Rinke ''et al.'' 2013>

== Etimología ==
Los nombres Microgenomatia (antes Microgenomates) y ''Microgenomatus'' para el género tipo se remontan a este
== Notas ==
>

LPSN: [https://lpsn.dsmz.de/ Buscar taxonomía].

LPSN: [https://lpsn.dsmz.de/class/microgenomatia Clase "''Candidatus'' Microgenomatia"] Herrmann ''et al.'' 2019.

GTDB: [https://gtdb.ecogenomic.org/tree?r=c__Microgenomatia Microgenomatia] (clase).

Base de datos de taxonomía del genoma (GTDB) versión 09-RS220
* * *

Centro Nacional de Información Biotecnológica | Navegador de taxonomía NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/B ... 0316&lvl=3 Candidatus Microgenomatia]. Detalles: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/B ... id=3470316 Candidatus Microgenomatia], GTDB (clase).

Centro Nacional de Información Biotecnológica | Navegador de taxonomía NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/B ... 7899&lvl=3 Candidatus Woykeibacteriota]; Detalles: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/B ... id=1817899 "Candidatus Woykeibacteriota"] corrig. Anantharaman et al. 2016; Sinónimo homotípico: "Candidatus Woykebacteria" Anantharaman et al. 2016 (filo).

Karthik Anantharaman, Christopher T. Brown, Laura A. Hug, Itai Sharon, Cindy J. Castelle, Alexander J. Probst, Brian C. Thomas, Andrea Singh, Michael J. Wilkins, Ulas Karaoz, Eoin L. Brodie, Kenneth H. Williams, Susan S. Hubbard, Jillian F. Banfield: "Miles de genomas microbianos arrojan luz sobre procesos biogeoquímicos interconectados en un sistema acuífero". En: ''Nature Communications'', Volumen 7, No. 13219, 24 de octubre de 2016;

Anne M. Brown, Samantha L. Hoopes, Robert H. White, Catherine A. Sarisky: ''Biosíntesis de purinas en arqueas: variaciones sobre un tema''. En: ''Biology Direct'', Volumen 6, No. 63, 14 de diciembre de 2011;

Patricia Geesink, Carl-Eric Wegner, Alexander J. Probst, Martina Herrmann, Hang T. Dam, Anne-Kristin Kaster, Kirsten Küsel: ''La resolución espacio-temporal inferida por el genoma de una Roizmanbacterium no cultivada revela sus preferencias ecológicas en las aguas subterráneas''. En: ''Microbiología ambiental'', Volumen 22, No. 2, 19 de noviembre de 2019, págs. 726-737;

Martina Herrmann, Carl-Eric Wegner, Martin Taubert, Patricia Geesink, Katharina Lehmann, Lijuan Yan, Robert Lehmann, Kai Uwe Totsche, Kirsten Küsel: ''El predominio de ''Cand.'' Las patescibacterias en las aguas subterráneas se deben a su movilización preferencial desde los suelos y a su florecimiento en condiciones oligotróficas.'' En: ''Frontiers in Microbiology'', Seg. Microbiología terrestre, Volumen 10, 20 de junio de 2019,

Vitaly V. Kadnikov, Andrey V. Mardanov, Alexey V. Beletsky, Olga V. Karnachuk, Nikolai V. Ravin: ''El genoma completo de un miembro de un nuevo linaje bacteriano en el grupo de microgenomatos revela una disparidad inusual en la composición de nucleótidos entre dos hebras de ADN y un potencial metabólico limitado''. En: ''MDPI'': ''Microorganisms'', número especial Evolución microbiana de Extremophiles, Volumen 8, No. 3, 25 de febrero de 2020, p. 320;

Vitaly V. Kadnikov, Andrey V. Mardanov, Alexey V. Beletsky, Olga V. Karnachuk, Nikolai V. Ravin: ''Vida microbiana en el acuífero profundo del subsuelo iluminada por la metagenómica''. En: ''Frontiers in Microbiology'', Sec. Microbiología extrema, Banda 11, 3 de septiembre de 2020;

Christian Rinke, Patrick Schwientek, Alexander Sczyrba, Natalia N. Ivanova, Iain J. Anderson, Jan-Fang Cheng, Aaron Darling, Stephanie Malfatti, Brandon K. Swan, Esther A. Gies, Jeremy A. Dodsworth, Brian P. Hedlund, George Tsiamis, Stefan M. Sievert, Wen-Tso Liu, Jonathan A. Eisen, Steven J. Hallam, Nikos C. Kyrpides, Ramunas Stepanauskas, Edward M. Rubin, Philip Hugenholtz, Tanja Woyke: ''Perspectivas sobre la filogenia y el potencial de codificación de la materia oscura microbiana''. En: ''Nature'', Band 499, 14. Julio de 2013, S. 431–437;

Categoría:Bacterias
Categoría:Batería

More details: https://de.wikipedia.org/wiki/Microgenomatia

1773046879

Anonymous

[h4] 

''Candidatus (Biología)|Candidatus'' '''Microgenomatia''' es una clase (Biología)|Clase de bacterias del filo (División (Biología)|División) Minisyncoccota (anteriormente llamado ''Candidatus (Biología)|Ca.'' Patescibacteriota o grupo CPR).

== Descripción ==
===  La clase actual “''Ca.'' Microgenomatia” originalmente se llamaba filo “Microgenomatos” o
===  En 2020, Vitaly V. Kadnikov et al. informó sobre la cepa Ch65 de Microgenomatia (Contig#MAGs|MAG), que secuenciaron mediante metagenómica. Según sugerencia de estos autores, Ch65 sirve como referencia para la nueva especie candidata "''Ca.'' Chazhemtobacterium Aquaticus" [LPSN: "''Ca.'' Chazhemtonibacterium Aquaticus"], especie tipo de la también nueva familia "Ca. Chazhemtonibacteriaceae", con familia hermana de la familia GTDB f__UBA12108 ["''Ca.'' Collierbacteraceae”]; ambos en orden GTDB o__UBA1400.>

Aunque las bacterias Ch65 no se pudieron cultivar, también son acuáticas porque su ADN proviene de un acuífero térmico subterráneo (~20°C|°C,La temperatura del agua fue más baja de lo esperado para un gradiente de temperatura típico de aproximadamente 20 Celsius|°C/kilómetro|km, pero es posible que el agua se haya enfriado a medida que fluía a través del pozo. pH valor|pH 7,43–7,60) en el pozo de producción de petróleo 5P de 2,8 km de profundidad cerca del pueblo de Chazhemto[https://mapcarta.com/de/15362434 Chazhemto]. En: Mapcarta (
El genoma Ch65 tiene 801.504 pares de bases (pb) de largo, tiene 838 genes codificantes (código genético de proteína) y tiene un contenido de G+C de 44,80%. Tiene una composición de nucleótidos muy inusual, con una hebra en toda su longitud que tiene un alto contenido de citosina en comparación con la guanina. Esto sugiere que la mayor parte del cromosoma bacteriano Ch65 se replica en una dirección. Sin embargo, tal asimetría en la composición de nucleótidos también se observó en las familias GTDB f__UBA12108 [“''Ca.'' Collierbacteraceae] y f__CG1-02-47-37 ['''Ca.'' Beckwithbacteraceae'] (ambas también en el orden GTDB o__UBA1400 ['''Ca.'' Chazhemtobacteriales"]).

Un análisis del genoma reveló que la bacteria Ch65 probablemente tiene forma de bastón y es móvil. Tiene un estilo de vida anaeróbico, es decir, es organotrófico obligado con un metabolismo fermentativo, por lo que puede producir acetato y lactato.
Sin embargo, no tiene cadena respiratoria ni vías metabólicas completas para la biosíntesis de ácidos grasos/lípidos, aminoácidos y nucleótidos.
La vía de la glucólisis de Embden-Meyerhof (glucólisis) y la vía de las pentosas fosfato no oxidativas (vía de las pentosas fosfato) están en gran parte completas, pero no se encontraron genes para la glucoquinasa (GCK), la fosfofructoquinasa 1 | 6-fosfofructoquinasa (PFK1) y la transaldolasa (TAL).
La bacteria Ch65 carece de glicosidasas secretadas (glucósido hidrolasas) y transportadores convencionales (proteína de membrana) para la importación de azúcares y aminoácidos.

Las propiedades metabólicas predichas a partir de la secuencia de ADN indican que Ch65 es
* vive de desechos|escombros (biología) (“carroña microbiana”) y obtiene recursos de la biomasa microbiana lisada|lisis (biología), o
* en simbiosis (posiblemente parasitarias) con otros organismos, como es demostrablemente el caso de otras clases de Minisyncocota (por ejemplo, Minisyncoccia y Saccharimonadia).>

=== Biosíntesis de purinas ===
Como también encontraron estos autores, las cepas SCGC AAA011-A19 y SCGC AAA011-L05 (ambas del subclado OP11-1) utilizan una ruta metabólica para la biosíntesis de las purinas adenina y guanina que sólo se conoce de archaea y probablemente se lleva a cabo por representantes del reino Methanobacteriati (reino de archaea (biología)) a través de transferencia lateral de genes (LGT). (antes llamada “Euryarchaeida” o “Euryarchaeota”).
La biosíntesis de purinas se realiza en bacterias y arqueas con respecto a su penúltimo paso (el ribonucleadoWikcionario: wikt:en:ribonucleate|ribonucleate ( Todas las bacterias secuenciadas hasta ese momento (2013) utilizan la enzima PurH1 para este paso, mientras que la mayoría de las arqueas utilizan la enzima PurP.>>
Sin embargo, los miembros de Minisyncoccota (anteriormente: "''Ca.'' Patescibacteriota" o "Patescibacteria") no tienen el gen "purH1", sino que tienen un gen similar a "purP": las metanobacterias utilizan la enzima PurP para este paso. Como argumentan los autores, esto sugiere una antigua transferencia lateral de la mayor parte del operón de biosíntesis de purina de un donante similar a los termococos al ancestro de Minisyncoccota (“Patescibacteria”).

=== Propiedades del genoma (o__UBA1400) ===
Tamaños del genoma y composición de nucleótidos de genomas completos de miembros del orden candidato o__UBA1400 [“''Ca.'' Chazhemtobacteriales”]:

== Sistemática ==
En [url=viewtopic.php?t=8725]Christian Rinke[/url] ''et al.'' (2013) el clado OP11 todavía se clasifica como un filo (departamento (biología)|departamento,
El sistema del grupo al 7 de marzo de 2026 (extractos) es el siguiente:

Clase “''Ca.'' '''Microgenomatia'''”  -->
* Orden ''incertae sedis''(L)
** Clado (¿familia?) OP11-1(R)
*** Género ''incertae sedis''
**** Especie Microgenomatos bacteria SCGC AAA011-A19(N,R) [División candidata OP11 bacteria SCGC AAA011-A19(N)]
**** Especie Microgenomatos bacteria SCGC AAA011-L05(N,R) [División candidata OP11 bacteria SCGC AAA011-L05(N)]
**** Especie Microgenomatos bacteria SCGC AAA011-F5(N,R) [División candidata OP11 bacteria SCGC AAA011-F5(N)]
** Clado (¿familia?) OP11-2(R)
*** Género ''incertae sedis''
**** Especie Microgenomatos bacteria SCGC AAA255−J07(N,R) [División candidata OP11 bacteria SCGC AAA255−J07(N)]
**** Especie Microgenomatos bacteria SCGC AAA011−B20(N,R) [División candidata OP11 bacteria SCGC AAA011−B20(N)]
** Clado (¿familia?) OP11-4b(R)
*** Género “''Ca.'' '''Microgenomatus'''”  **** Especie “''Aprox.'' '''Microgenomatus auricola'''”  **** Especie ''Aprox.'' Microgenomatus sp. aislar SulCav_AS07-7_2_38_32(N)
**** Especie ''Aprox.'' Microgenomatus sp. aislar SulCav_AS07-7_35_29(N)
**** Especie ''Aprox.'' Microgenomatus sp. aislar BE2012_2_50_27(N)
*** Gattung ''incertae sedis''
**** Spezies ''Ca.'' Microgenomates bacteria SCGC AAA011-M05(N,R) [División candidata OP11 bacteria SCGC AAA011-M05(N)]
**** Spezies Bacteria OP11 de división candidata no cultivada … clon BB35(N) mit Stamm 83319022(R) alias BB35(N)
** Klade (¿Familia?) OP11-4c(R)
*** Gattung ''incertae sedis''
**** Spezies Microgenomates bacteria SCGC AAA011-L6(N,R) [División candidata OP11 bacteria SCGC AAA011-L6(N)]
** Familia y Gattung ''incertae sedis''
**:* Spezies Microgenomates bacteria SCGC AAA011−B20(N,R) [División candidata OP11 bacteria SCGC AAA011-B20(N)]
**:* Especies  **:* Especies
* Ordnung „''Ca.'' Chazhemtobacteriales“(G°) [o__UBA1400(G)]
**  *** Gattung ''CG1-02-47-37''(G)
**** Spezies ''CG1-02-47-37 sp002772455''(G) [''Ca.'' Bacteria Beckwithbacteria CG23_combo_of_CG06-09_8_20_14_all_47_9(N,G)]
*** Gattung ''GWC1-49-16''
**** Spezies ''GWC1-49-16 sp001029675''(G) [''Ca.'' Bacteria Beckwithbacteria GW2011_GWC1_49_16(N,G)]
**  *** Gattung ''PSRQ01''(G)
**** Spezies ''PSRQ01 sp003176165''(G) [''Ca.'' Cerribacteria bacteria 'Amazon FNV 2010 28 9'(N,G)]
*** Gattung ''UBA12028''
**** Spezies ''UBA12028 sp001002285''(G) [Bacteria del grupo de microgenomatos GW2011_GWC1_46_15(N,G)]
*** Gattung …(G)
** Familia „''Ca.'' Chazhemtonibacteriaceae“ corrig.  *** Gattung „''Ca.'' Chazhemtonibacterium“ corrig.  **** Spezies „''Ca.'' Chazhemtonibacterium acuáticos“ corrig. -->
**  *** Gattung ''2-01-FULL-49-14''(G)
**** Spezies ''2-01-FULL-49-14 sp001816915''(G) [''Ca.'' Chisholmbacteria bacteria RIFCSPLOWO2_01_FULL_49_14(N,G)]
*** Gattung …(G)
**  *** Gattung ''UBA12108''(G)
**** Spezies ''UBA12108 sp001002415''(G) [''Ca.'' Collierbacteria bacteria RIFOXYD1_FULL_46_26(N,G)]
*** Gattung …(G)
*** Gattung ''incertae sedis''
**** Spezies Candidatus Collierbacteria bacteria RIFOXYD2_FULL_45_13(N)>
**  *** Gattung ''1-14-0-10-56-10''
**** Spezies ''1-14-0-10-56-10 sp002772645''(G) [''Ca.'' Pacebacteria bacteria CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_56_10(N,G)]
*** Gattung ''CG1-02-43-3''
**** Spezies ''CG1-02-43-31 sp002788675''(G) [''Ca.'' Pacebacteria bacteria CG_4_9_14_0_2_um_filter_40_15(N,G)]
*** Gattung ''CG2-30-36-39''
**** Spezies ''CG2-30-36-39 sp001873435''(G) [''Ca.'' Pacebacteria bacteria CG2_30_36_39(N,G)
*** Gattung ''PJMF01''(G)
**** Spezies ''PJMF01 sp003173865''(G) [''Ca.'' Aislado de bacteria Minisyncoccota Amazon_FNV_2010_13_2_2(N), ''Ca.'' Aislado de bacteria Paceibacterota Amazon_FNV_2010_13_2_2(G)]
*** Gattung ''UBA10119''
**** Spezies ''UBA10119 sp001002135''(G) [''Ca.'' Pacebacteria bacteria GW2011_GWA1_46_10(N,G)]
*** Gattung ''UBA1364''
**** Spezies ''UBA1364 sp020724725''(G) [''Ca.'' Microgenomatus sp. aislar BE2012_5_35_30(N,G)]
**** Spezies ''UBA1364 sp001029715''(G) [División candidata bacteria TM6 GW2011_GWF2_28_16(N,G)]
*** Gattung ''UBA1388''
**** Spezies ''UBA1388 sp002772705''(G) [''Ca.'' Pacebacteria bacteria CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_44_11(N,G)]
*** Gattung ''UM-FILTER-42-14''**** Spezies ''UM-FILTER-42-14 sp002772695''(G) [''Ca.'' Pacebacteria bacteria CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_44_54(N,G)]
*** Gattung …(G)
** Familia f__MFAQ01(G) – abgetrennt von „#Collierbacteria|Collierbacteraceae“ [f__UBA12108]
*** Gattung ''MFAQ01''(G)
**** Spezies ''MFAQ01 sp001776275''(G) [''Ca.'' Collierbacteria bacteria RIFOXYD1_FULL_40_9(N,G)]
*** Gattung ''UBA2277''(G)
**** Spezies ''UBA2277 sp000998275''(G) [''Ca.'' Bacteria Collierbacteria GW2011_GWA2_42_17(N,G), División candidata Bacteria CPR1 GW2011_GWA2_42_17(N,G)Beide Stämme werden here (im Gegensatz zu GTDB und der NCBI-Taxonomie) como alias aufgefasst: der lange Name sollte eindeutig sein.
*** Gattung …(G)
** Familia f__PJMF01(G)
*** Gattung ''UBA1364''(G)
**** Spezies ''UBA1364 sp020724725''(G) [''Ca.'' Microgenomatus sp. aislar BE2012_4_39_12(N)] (movido)
** Familia f__UBA1400(G) – separada de “#Beckwithbacteria|Beckwithbacteraceae” [f__CG1-02-47-37]
*** Género ''1-14-0-10-34-10''(G)
**** Especie ''1-14-0-10-34-10 sp002773945''(G) [''Aprox.'' Bacteria Beckwithbacteria CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_34_10(N,G)]
*** Género ''UBA1400''(G)
**** Especie ''UBA1400 sp002305125''(G) [Bacteria del grupo Patescibacteria UBA1400(N,G)]
*** Género…(G)
** Familia f__UBA1449(G) – separada de “#Beckwithbacteria|Beckwithbacteraceae” [f__CG1-02-47-37]
*** Género ''JAAZND01''
**** Especie ''JAAZND01 sp012798485''(G) [''Aprox.'' Aislamientos de bacteria Beckwithbacteria AS27yjCOA_127(N,G)]
*** Género ''JAAZOH01''
**** Especie ''JAAZOH01 sp012797845''(G) [''Aprox.'' Aislamientos de bacteria Beckwithbacteria AS27yjCOA_42(N,G)]
*** Género ''UBA1449''(G)
**** Especie ''UBA1449 sp002335355''(G) [Bacteria del grupo Patescibacteria UBA1449(N,G)
**Familia…(G)

*  ** Familia f__DATCJB01(G)
*** Género ''DATCJB01''(G)
**** Especie ''DATCJB01 sp036507455''(G) [Aislamientos de bacterias del grupo Patescibacteria SMAG_U7874(N,G)]
** Familia f__GWA2-41-24(G)según GTDB, todas las cepas identificadas como Curtissbacteria en la taxonomía NCBI pertenecen a esta familia.
*** Género ''GWA2-41-24''(G)
**** Especie ''GWA2-41-24 sp001775055''(G) [''Aprox.'' Curtissbacteria bacteria RIFCSPLOWO2_02_41_11(N,G)]
*** Género…(G)

*  ** Familia f__UBA10151(G)
*** Género ''GWC1-40-9''(G)
**** Especie ''GWC1-40-9 sp000997385''(G) [''Aprox.'' Daviesbacteria bacteria GW2011_GWA1_41_61(N,G)]
*** Género ''UBA10151''(G)
**** Especie ''UBA10151 sp001776935''(G) [''Aprox.'' Daviesbacteria bacteria RIFCSPLOWO2_01_FULL_39_23(N,G)]
*** Género…(G)

*  ** Familia f__UBA10105(G)
*** Género ''UBA10105''(G)
**** Especie ''UBA10105 sp000995415''(G) [''Aprox.'' Gottesmannbacteria bacteria GW2011_GWC1_43_10(N,G)]
**Familia…(G)

*  ** Familia f__GWA1-39-11(G)
*** Género ''SURF-62''(G)
**** Especie ''SURF-62 sp003599595''(G) [''Aprox.'' Aislamientos de la bacteria Parcubacteria SURF_62(N,G)]
** Familia f__JACOYD01(G)
** Familia f__UBA12049(G)según GTDB, casi todas las cepas etiquetadas como Levybacteria en la taxonomía NCBI pertenecen a esta familia.
*** Género ''01-FULL-36-15b''
**** Especie ''01-FULL-36-15b sp001782035''(G) [''Aprox.'' Levybacteria bacteria RIFCSPHIGHO2_01_FULL_37_17(N,G)]

*  ** Familia f__GWC2-37-13(G)
*** Género ''GWC2-37-13''(G)
**** Especie ''GWC2-37-13 sp000990305'' [''Aprox.'' Roizmanbacteria bacteria GW2011_GWC2_34_23(N,G)]
**** Especie ''GWC2-37-13 sp000990565'' [''Aprox.'' Bacteria Roizmanbacteria GW2011_GWC1_37_12(N,G)]
*** Gattung ''UBA1450''(G)
**** Spezies ''UBA1450 sp000990445''(G) [''Ca.'' Roizmanbacteria bacteria GW2011_GWA2_37_7(N,G)
**** Spezies ''UBA1450 sp002329205''(G) [’’Ca.’’ Candidatus Roizmanbacteria bacteria UBA1450(N,G)
*** Gattung „''Roizmanbacterium''“  **** Spezies ''Ca.'' Roizmanbacterium ADI133>
*** Gattung …(G)
** Familia f__HO2-37-13b
*** Gattung ''OLB22''(G)
**** Spezies ''OLB22 sp001567515''(G) [Microgenomates bacteria OLB22(N,G), División candidata OP11 bacteria OLB22(N)]
*** Gattung ''OLB23''(G)
**** Spezies ''OLB23 sp001567245''(G) [Microgenomates bacteria OLB23(N,G), División candidata OP11 bacteria OLB23(N)]
*** Gattung …(G)
** Familia f_UBA1406(G)

*  ** Familia BS750m-G30(G)
** Familia f__JAHJSD01(G)
** Familia f__JAUWLS01(G)
** Familia f__UBA12405(G)
*** Gattung ''UBA12405''
**** Spezies ''UBA12405 sp003542615''(G) [''Ca.'' Aislado de bacteria Shapirobacteria UBA12405(N,G)]
** Familia f__UBA6130(G)

*  ** Familia f__2-01-FULL-43-14(G)
** Familia f__JBBROZ01(G)
** Familia f__RBG-16-39-9b(G)nach der GTDB gehören fast alle in der NCBI-Taxonomie as Woykebacteria gekennzeichneten Stämme zu esta familia.

* Ordnung o__0-14-0-10-38-17(G) – abgetrennt von „#Shapirobacteria|Shapirobacterales“ [o__UBA12405]
** Familia f__0-14-0-10-38-17(G)
*** Gattung ''0-14-0-10-38-17''(G)
**** Spezies ''0-14-0-10-38-17 sp002774085''(G) [''Ca.'' Bacteria Shapirobacteria CG09_land_8_20_14_0_10_38_17(N,G)]
**  *** Gattung ''01-FULL-43-15b''
**** Spezies ''01-FULL-43-15b sp001816385''(G) [''Ca.'' Bacteria Blackburnbacteria RIFCSPHIGHO2_01_FULL_43_15b(N,G)]
*** Gattung ''2-12-FULL-44-25''(G)
**** Spezies ''2-12-FULL-44-25 sp001816455''(G) [''Ca.'' Bacteria Blackburnbacteria RIFCSPHIGHO2_12_FULL_44_25(N,G)]
*** Gattung ''GCA-2686465''(G)
**** Spezies ''GCA-2686465 sp002686465''(G) [''Ca.'' Aislado de bacteria Woesebacteria ARS1183(N,G)] (verschoben)
*** Gattung ''JACPEJ01''(G)
**** Spezies ''JACPEJ01 sp016183565''(G) [''Ca.'' Aislado de bacteria Blackburnbacteria NC_groundwater_332_Ag_B-0.1um_41_18(N,G)]
*** Gattung ''UBA10165''(G)
**** Spezies ''BA10165 sp001816475''(G) [''Ca.'' Bacteria Blackburnbacteria RIFCSPLOWO2_01_FULL_40_20(N,G)]
*** Gattung …(G)
**  *** Gattung ''2-01-FULL-44-10''(G)
**** Spezies ''2-01-FULL-44-10 sp001792465''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria RIFCSPHIGHO2_01_FULL_44_10(N,G)]
*** Gattung ''DYGS01''(G)
**** Spezies ''DYGS01 sp020724585''(G) [''Ca.'' Microgenomatus sp. aislar BE2012_5_35_30(N,G)]
*** Gattung ''DYGT01''(G)
**** Spezies ''DYGT01 sp020724555''(G) [''Ca.'' Microgenomatus sp. aislar BE2012_6_40_25(N,G)]
*** Gattung ''GWB1-39-12''(G)
**** Spezies ''GWB1-39-12 sp000993405''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria GW2011_GWB1_39_12(N,G)]
*** Gattung ''GWC1-37-12b''(G)
**** Spezies ''GWC1-37-12b sp000993115''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria GW2011_GWB1_38_8b(N,G)]
*** Gattung ''GWC1-42-9''(G)
**** Spezies ''GWC1-42-9 sp000995185''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria GW2011_GWC1_42_9(N,G)]
*** Gattung ''GWF1-31-35''(G)
**** Spezies ''GWF1-31-35 sp001029755''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria GW2011_GWF1_31_35(N,G)]
*** Gattung ''LCIL01''(G)
**** Spezies ''LCIL01 sp001001045''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria GW2011_GWA1_44_23(N,G)]
*** Gattung ''RBG-16-42-24''(G)
**** Spezies ''RBG-16-42-24 sp001792115''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria RBG_16_42_24(N,G)]
*** Gattung ''UBA12026''(G)
**** Spezies ''UBA12026 sp000990005''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria GW2011_GWB1_33_38(N,G)]
*** Gattung ''UBA8517''(G)
*** Gattung ''WO2-FULL-39-9''(G)
**** Spezies ''WO2-FULL-39-9 sp001793155''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria RIFCSPLOWO2_01_FULL_39_61(N,G)]
*** Gattung ''WO2-FULL-39-10''(G)
**** Spezies ''WO2-FULL-39-10 sp001792345''(G) [''Ca.'' Woesebacteria bacteria RIFCSPHIGHO2_01_FULL_39_32(N,G)]
*** Gattung …(G)
** Familia f__GWA2-44-7(G)
*** Gattung ''GWA2-44-7''(G)
** Familia f__UBA8517(G)
*** Gattung ''DYGS01''(G)
**** Spezies ''DYGS01 sp020724585''(G) [''Ca.'' Microgenomatus sp. aislar BE2012_5_35_30(N)] (verschoben)
*** Gattung ''DYGT01''(G)
**** Spezies ''DYGT01 sp020724555''(G) [''Ca.'' Microgenomatus sp. aislar BE2012_6_40_25(N)] (movido)
**Familia…(G)

* Orden o__JACOXO01(G) – separado de “# Gottesmannbacteria| Gottesmannbacterales” [o__UBA10105]
** Familia f__JACOXO01(G)
*** Género ''JACOXO01''(G)
**** Especie ''JACOXO01 sp016182365''(G) [''Aprox.'' Aislamientos de la bacteria Gottesmannbacteria NC_groundwater_155_Ag_S-0.1um_35_9(N,G)]

* Orden o__JACPZF01(G) – separado de “# Gottesmannbacteria| Gottesmannbacterales” [o__UBA10105]
** Familia f__JACPZF01(G)
*** Género ''JACPZF01''(G)
**** Especie ''JACPZF01 sp016195615''(G) [''Aprox.'' ''Aprox.'' Aislamientos de la bacteria Gottesmannbacteria NC_groundwater_155_Ag_S-0.1um_35_9(N,G)]
*** Género…(G)

* Orden o__PFEM01(G) – separado de “#Shapirobacteria|Shapirobacterales” [o__UBA12405]
** Familia f__PFEM01(G)
**** Especie ''PFEM01 sp002793635''(G) [''Aprox.'' Bacteria Shapirobacteria CG10_big_fil_rev_8_21_14_0_10_48_15(N,G)]

* Orden o__UM-FILTER-39-15(G) - separado de "#Shapirobacteria|Shapirobacterales" [o__UBA12405]
** Familia UM-FILTER-39-15(G)
**** Especie ''UM-FILTER-39-15 sp002784465''(G) [''Aprox.'' Bacteria Shapirobacteria CG_4_10_14_0_8_um_filter_39_15(N,G)]

* Orden o__UM-FILTER-40-11(G) - separado de "#Shapirobacteria|Shapirobacterales" [o__UBA12405]
** Familia f__UM-FILTER-40-11(G)
**** Especie ''UM-FILTER-40-11 sp002780305''(G) [''Aprox.'' Aislamiento de bacteria Shapirobacteria SZUA-533(N,G)]

* Orden o__VGLL01(G) – separado de “#Shapirobacteria|Shapirobacterales” [o__UBA12405]
** Familia f__VGLL01(G)
**** Especie ''VGLL01 sp016866735''(G) [''Aprox.'' Aislado de bacteria Shapirobacteria BS750m-G30(N,G)]

* Está bien...(G)

Turnos según GTDB:
* por clase “''Ca.'' Patescibacteriia”:
** Cepa ''Microgenomatus auricola'' Bin_28_1_1(N) ⇒ ''Microgenomatus_A auricola_A''(G)
** Cepa ''Microgenomatus auricola'' Bin_40(N) ⇒ ''Microgenomatus_B auricola_A''(G)
* por clase Minisyncoccia:
** ''Aprox.'' Microgenomatus sp. aislar BE2012_3_53_27(N) ⇒ ''DYGI01 sp020724805''(G)
----
*L-  * L° – entrada LPSN huérfana (taxón sin sistemática interna y externa designada, pero posiblemente Sinónimos),
* N – Taxonomía de  *G-  * G° – GTDB (obsoleto) Versión 09-RS220>
* R – [url=viewtopic.php?t=8725]Christian Rinke[/url] ''et al.'' 2013>

== Etimología ==
Los nombres Microgenomatia (antes Microgenomates) y ''Microgenomatus'' para el género tipo se remontan a este
== Notas ==
>



LPSN: [https://lpsn.dsmz.de/ Buscar taxonomía].


LPSN: [https://lpsn.dsmz.de/class/microgenomatia Clase "''Candidatus'' Microgenomatia"] Herrmann ''et al.'' 2019.


GTDB: [https://gtdb.ecogenomic.org/tree?r=c__Microgenomatia Microgenomatia] (clase).

Base de datos de taxonomía del genoma (GTDB) versión 09-RS220
*  *  *  

Centro Nacional de Información Biotecnológica | Navegador de taxonomía NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?command=show&mode=tree&id=3470316&lvl=3 Candidatus Microgenomatia]. Detalles: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?command=show&mode=node&id=3470316 Candidatus Microgenomatia], GTDB (clase).


Centro Nacional de Información Biotecnológica | Navegador de taxonomía NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?command=show&mode=tree&id=1817899&lvl=3 Candidatus Woykeibacteriota]; Detalles: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=1817899 "Candidatus Woykeibacteriota"] corrig. Anantharaman et al. 2016; Sinónimo homotípico: "Candidatus Woykebacteria" Anantharaman et al. 2016 (filo).



Karthik Anantharaman, Christopher T. Brown, Laura A. Hug, Itai Sharon, Cindy J. Castelle, Alexander J. Probst, Brian C. Thomas, Andrea Singh, Michael J. Wilkins, Ulas Karaoz, Eoin L. Brodie, Kenneth H. Williams, Susan S. Hubbard, Jillian F. Banfield: "Miles de genomas microbianos arrojan luz sobre procesos biogeoquímicos interconectados en un sistema acuífero". En: ''Nature Communications'', Volumen 7, No. 13219, 24 de octubre de 2016;  

Anne M. Brown, Samantha L. Hoopes, Robert H. White, Catherine A. Sarisky: ''Biosíntesis de purinas en arqueas: variaciones sobre un tema''. En: ''Biology Direct'', Volumen 6, No. 63, 14 de diciembre de 2011;  



Patricia Geesink, Carl-Eric Wegner, Alexander J. Probst, Martina Herrmann, Hang T. Dam, Anne-Kristin Kaster, Kirsten Küsel: ''La resolución espacio-temporal inferida por el genoma de una Roizmanbacterium no cultivada revela sus preferencias ecológicas en las aguas subterráneas''. En: ''Microbiología ambiental'', Volumen 22, No. 2, 19 de noviembre de 2019, págs. 726-737;  

Martina Herrmann, Carl-Eric Wegner, Martin Taubert, Patricia Geesink, Katharina Lehmann, Lijuan Yan, Robert Lehmann, Kai Uwe Totsche, Kirsten Küsel: ''El predominio de ''Cand.'' Las patescibacterias en las aguas subterráneas se deben a su movilización preferencial desde los suelos y a su florecimiento en condiciones oligotróficas.'' En: ''Frontiers in Microbiology'', Seg. Microbiología terrestre, Volumen 10, 20 de junio de 2019,  

Vitaly V. Kadnikov, Andrey V. Mardanov, Alexey V. Beletsky, Olga V. Karnachuk, Nikolai V. Ravin: ''El genoma completo de un miembro de un nuevo linaje bacteriano en el grupo de microgenomatos revela una disparidad inusual en la composición de nucleótidos entre dos hebras de ADN y un potencial metabólico limitado''. En: ''MDPI'': ''Microorganisms'', número especial Evolución microbiana de Extremophiles, Volumen 8, No. 3, 25 de febrero de 2020, p. 320;  

Vitaly V. Kadnikov, Andrey V. Mardanov, Alexey V. Beletsky, Olga V. Karnachuk, Nikolai V. Ravin: ''Vida microbiana en el acuífero profundo del subsuelo iluminada por la metagenómica''. En: ''Frontiers in Microbiology'', Sec. Microbiología extrema, Banda 11, 3 de septiembre de 2020;  

Christian Rinke, Patrick Schwientek, Alexander Sczyrba, Natalia N. Ivanova, Iain J. Anderson, Jan-Fang Cheng, Aaron Darling, Stephanie Malfatti, Brandon K. Swan, Esther A. Gies, Jeremy A. Dodsworth, Brian P. Hedlund, George Tsiamis, Stefan M. Sievert, Wen-Tso Liu, Jonathan A. Eisen, Steven J. Hallam, Nikos C. Kyrpides, Ramunas Stepanauskas, Edward M. Rubin, Philip Hugenholtz, Tanja Woyke: ''Perspectivas sobre la filogenia y el potencial de codificación de la materia oscura microbiana''. En: ''Nature'', Band 499, 14. Julio de 2013, S. 431–437;  


Categoría:Bacterias
Categoría:Batería [/h4]

More details: [url]https://de.wikipedia.org/wiki/Microgenomatia[/url]

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